Los hechos del caso se refieren a la desaparición forzada de Efraín Bámaca Velásquez, comandante del grupo guerrillero Organización del Pueblo en Armas (ORPA), tras ser capturado -en marzo de 1992- por agentes del Ejército. Durante su cautiverio, el Sr. Bámaca Velásquez fue sometido a tortura.

La Corte IDH ubicó los hechos en el contexto del conflicto armado interno ocurrido en Guatemala, poniendo en evidencia la práctica del ejército de capturar guerrilleros y mantenerlos en reclusión clandestina para efectos de obtener información mediante torturas.

El Estado reconoció su responsabilidad internacional por la violación al deber estatal de respetar y garantizar los derechos establecidos en la Convención Interamericana. Sin perjuicio de ello, la Corte IDH desarrolló estándares sobre las características de la desaparición forzada como violación múltiple de derechos y sobre la violación al derecho a la integridad personal de las víctimas y sus familiares en este tipo de prácticas.